Z hľadiska ochrany vôd pred jej znečistením a znehodnotením je nutné predovšetkým odstrániť príčiny jej znečistenia. Zvýšenú pozornosť je potrebné venovať objektom poľnohospodárskej výroby – aplikácia agrochemikálií a odpadové vody zo živočíšnej výroby, skládkam odpadov, produktovodom, cestám, ale hlavne riešiť problematiku adekvátneho čistenia odpadových vôd:

• budovanie čistiarní odpadových vôd v priemyselnej a komunálnej sfére vrátane kanalizačnej siete – na území mesta je potrebné dobudovať kanalizačnú sieť v lokalitách Barca, Dargovských Hrdinov, Myslava, Šebastovce, Lorinčík, Poľov,
• zabezpečiť vybudovanie komplexnej kanalizácie v mestskej časti Krásna nad Hornádom, Kavečany aj pre územie ZOO s vybudovaním čistiarne odpadových vôd, Košická Nová Ves a obce Ťahanovce,
• vybudovať novú kanalizáciu na ulici Suchodolinskej, Kostolianska na Podhradovú,
• rekonštruovať kanalizačný zberač AVI (nám. Osloboditeľov) a A14 (Alejová ulica), kanalizáciu na Luniku II a III,